ITALIANO

Genetica, Biologia Molecolare

Lezioni frontali ed esercitazioni in laboratorio di informatica

Il corso si propone di fornire le conoscenze di base in genetica delle popolazioni con particolare attenzione ai metodi statistici e computazionali con applicazione in genetica umana, medica, e di conservazione delle popolazioni naturali.

- Basi di genetica di popolazione: diversita' genetica, frequenze alleliche e genotipiche, Test di assegnazione, inbreeding, linkage disequilibrium, deriva genetica, selezione.
- Cenni di teoria della coalescenza.
- Third-generation sequencing e optical mapping per assemblare genomi de novo
- Bioinformatica: dal dato grezzo all'identificazione delle varianti in un campione di individui.
- Cenni di genetica dei caratteri quantitativi
- Metodologie innovative per lo studio del genoma, del trascrittoma e del
metiloma.
- Meccanismi epigenetici di controllo dell'espressione genica. Epimutazioni ed effetti transgenerazionali.
- Diagnosi genetica prenatale.
- Basi genetiche della resistenza agli agrofarmaci negli insetti parassiti e
vettori di malattie negli animali e nelle piante.

L'esame consiste in una prova scritta divisa in due parti. Nella prima parte lo studente e' chiamato a rispondere a 16 domande a risposta chiusa, ciascuna con punteggio massimo di 2 e valutazione immediata. Si accede alla seconda parte se il punteggio della prima risulta essere superiore a 15. Nella seconda parte lo studente deve completare un esercizio e rispondere a due domande aperte, ciascuna con punteggio massimo di 10. Il voto finale della prova scritta risulterà dalla media delle due parti. Lo studente può accettare il voto della prova scritta o richiedere una ulteriore prova orale che consisterà di una domanda e potrà modificare il voto dello scritto di 2-3 punti massimo (in positivo o negativo). Solo durante il corso sono previste due prove scritte parziali (una a metà corso ed una alla fine) con le stesse modalità descritte sopra. Tutte le prove scritte verranno effettuate sulla piattaforma eLearning Moodle seguendo le indicazioni del docente.

Titolo: Genetica delle popolazioni umane
Autore: John H. Relethford
Editore: CEA (13 maggio 2013)
ISBN-10: 8808184404
ISBN-13: 978-8808184405

Titolo: Fondamenti di bioinformatica
Autori: Helmer Citterich, Manuela, Fabrizio Ferrè, Giulio Pavesi, Graziano Pesole, Chiara Romualdi
Editore: Zanichelli (1 gennaio 2018)
ISBN-10: 880862112X
ISBN-13: 978-8808621122

Titolo: An Introduction to Population Genetics: Theory and Applications
Autori: Rasmus Nielsen, Montgomery Slatkin
Editore: OUP USA; 1st ed. 2013 edizione (19 luglio 2013)
ISBN-10: 1605351539
ISBN-13: 978-1605351537

Titolo: Population Genetics: A Concise Guide
Autore: John H. Gillespie
Editore: Johns Hopkins Univ Pr; 2 edizione (7 settembre 2004)
ISBN-10: 9780801880094
ISBN-13: 978-0801880094

Titolo: Principles of Population Genetics 4th Edition
Autori: Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark
Editore: Sinauer Associates, Inc.; 4th edition (2006-12-31)
ISBN-13: 978-0878933082
ISBN-10: 0878933085

Titolo: Population Genetics Notes
Autore: Graham Coop
OpenAccess: https://github.com/cooplab/popgen-notes