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Genetica, Biologia Molecolare

Lezioni frontali ed esercitazioni in laboratorio di informatica

Il corso si propone di fornire le conoscenze di base in genetica delle popolazioni con particolare attenzione ai metodi statistici e computazionali con applicazione in genetica umana, medica, e di conservazione delle popolazioni naturali.

- Basi di genetica di popolazione: diversita' genetica, frequenze alleliche e genotipiche, Test di assegnazione, inbreeding, linkage disequilibrium, deriva genetica, selezione.
- Cenni di teoria della coalescenza.
- Third-generation sequencing e optical mapping per assemblare genomi de novo
- Bioinformatica: dal dato grezzo all'identificazione delle varianti in un campione di individui.
- Cenni di genetica dei caratteri quantitativi
- Metodologie innovative per lo studio del genoma, del trascrittoma e del
metiloma.
- Meccanismi epigenetici di controllo dell'espressione genica. Epimutazioni ed effetti transgenerazionali.
- Diagnosi genetica prenatale.
- Basi genetiche della resistenza agli agrofarmaci negli insetti parassiti e
vettori di malattie negli animali e nelle piante.

L'esame finale consiste in una prova scritta di 15 quesiti che includono domande a risposta chiusa, aperta ed esercizi. Tempo a disposizione: 2 ore. In caso di superamento della prova scritta, e' facoltativa una prova orale di 1-2 domande.

Titolo: Genetica delle popolazioni umane
Autore: John H. Relethford
Editore: CEA (13 maggio 2013)
ISBN-10: 8808184404
ISBN-13: 978-8808184405

Titolo: Fondamenti di bioinformatica
Autori: Helmer Citterich, Manuela, Fabrizio Ferrè, Giulio Pavesi, Graziano Pesole, Chiara Romualdi
Editore: Zanichelli (1 gennaio 2018)
ISBN-10: 880862112X
ISBN-13: 978-8808621122

Titolo: An Introduction to Population Genetics: Theory and Applications
Autori: Rasmus Nielsen, Montgomery Slatkin
Editore: OUP USA; 1st ed. 2013 edizione (19 luglio 2013)
ISBN-10: 1605351539
ISBN-13: 978-1605351537

Titolo: Population Genetics: A Concise Guide
Autore: John H. Gillespie
Editore: Johns Hopkins Univ Pr; 2 edizione (7 settembre 2004)
ISBN-10: 9780801880094
ISBN-13: 978-0801880094

Titolo: Principles of Population Genetics 4th Edition
Autori: Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark
Editore: Sinauer Associates, Inc.; 4th edition (2006-12-31)
ISBN-13: 978-0878933082
ISBN-10: 0878933085

Titolo: Population Genetics Notes
Autore: Graham Coop
OpenAccess: https://github.com/cooplab/popgen-notes