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Genetica, Biologia Molecolare, Bioinformatica

Lezioni frontali ed esercitazioni in laboratorio informatico

Il corso si propone di fornire gli elementi di base per comprendere ed applicare la teoria della genetica allo studio delle popolazioni in ambito evolutivo, medico, di conservazione.
Una parte fondamentale del corso e' dedicata alle applicazioni bioinformatiche per l'analisi di dati genomici.

- Genetica delle popolazioni
- Third-generation sequencing e optical mapping per l'assemblaggio di genomi de novo
- Deriva genetica
- Selezione
- Linkage disequilibrium
- Inbreeding
- Teoria della coalescenza
-Bioinformatica finalizzata all'analisi di dati genomici
- Cenni di genetica dei caratteri quantitativi
- Metodologie innovative per lo studio del genoma, del trascrittoma e del metiloma;
- Meccanismi epigenetici di controllo dell'espressione genica.
Epimutazioni ed effetti transgenerazionali.
- Diagnosi genetica preimpianto e prenatale.
- Basi genetiche della resistenza agli agrofarmaci negli insetti parassiti e vettori di malattie negli animali e nelle piante.

L'esame finale consiste in una prova scritta di 15 quesiti che includono domande a risposta chiusa, aperta ed esercizi. Tempo a disposizione: 2 ore. In caso di superamento della prova scritta, e' facoltativa una prova orale di 1-2 domande.

Titolo: Genetica delle popolazioni umane
Autore: John H. Relethford
Editore: CEA (13 maggio 2013)
ISBN-10: 8808184404
ISBN-13: 978-8808184405

Titolo: Fondamenti di bioinformatica
Autori: Helmer Citterich, Manuela, Fabrizio Ferrè, Giulio Pavesi, Graziano Pesole, Chiara Romualdi
Editore: Zanichelli (1 gennaio 2018)
ISBN-10: 880862112X
ISBN-13: 978-8808621122

Titolo: An Introduction to Population Genetics: Theory and Applications
Autori: Rasmus Nielsen, Montgomery Slatkin
Editore: OUP USA; 1st ed. 2013 edizione (19 luglio 2013)
ISBN-10: 1605351539
ISBN-13: 978-1605351537

Titolo: Population Genetics: A Concise Guide
Autore: John H. Gillespie
Editore: Johns Hopkins Univ Pr; 2 edizione (7 settembre 2004)
ISBN-10: 9780801880094
ISBN-13: 978-0801880094

Titolo: Principles of Population Genetics 4th Edition
Autori: Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark
Editore: Sinauer Associates, Inc.; 4th edition (2006-12-31)
ISBN-13: 978-0878933082
ISBN-10: 0878933085

Titolo: Population Genetics Notes
Autore: Graham Coop
OpenAccess: https://github.com/cooplab/popgen-notes