Guida degli insegnamenti
Syllabus
Partially translatedTradotto parzialmente
Francesco PIVA
Lingua di erogazione: ITALIANOLessons taught in: ITALIAN
Laurea - [MT05] Tecniche di laboratorio biomedico (abilitante alla professione sanitaria di Tecnico di laboratorio biomedico) First Cycle Degree (3 years) - [MT05] Biomedical Laboratory techniques
Dipartimento: [040024] Dipartimento Scienze Biomediche e Sanita' PubblicaDepartment: [040024] Dipartimento Scienze Biomediche e Sanita' Pubblica
Anno di corsoDegree programme year : 2 - Secondo Semestre
Anno offertaAcademic year: 2018-2019
Anno regolamentoAnno regolamento: 2017-2018
Obbligatorio
Crediti: 1
Ore di lezioneTeaching hours: 10
TipologiaType: F - Altro
Settore disciplinareAcademic discipline: BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
ITALIANO
Italian
Conoscenza della Biologia e della Biochimica
Knowledge of the principles of Biology and Biochemistry
Lezioni frontali ed esercitazioni al computer
Frontal lessons and computer exercises
Alla fine del corso lo studente dovrà conoscere la struttura delle banche dati contenenti informazioni biologiche, i genome browser, i programmi di predizione riguardanti l’effetto delle mutazioni e la regolazione effettuata dai microRNA.
Capacità di applicare conoscenze e comprensione.
Lo studente dovrà essere in grado di trovare la sequenza di un gene a partire dal nome, trovare la sequenza proteica, localizzare il gene nel cromosoma, riconoscere la struttura del gene in termini di UTR, introni, esoni, siti di inizio di trascrizione alternativa. A partire dai browser genomici lo studente deve saper localizzare i polimorfismi e recuperare i dati di espressione.
Competenze trasversali.
Le competenze acquisite rappresenteranno elementi di base indispensabili per comprendere e affrontare problemi in biologia, patologia, diagnostica molecolare.
Knowledge and Understanding.
At the end of the course, the student will have to know the structure of databases containing biological information, genome browsers, prediction software regarding the effect of mutations and regulation by microRNAs.
Capacity to apply Knowledge and Understanding.
The student must be able to find the sequence of a gene from the gene name, find the protein sequence, locate the gene in the chromosome, recognize the gene structure in terms of UTR, introns, exons, alternative transcription start sites. Starting from genomic browsers, the student must be able to locate the polymorphisms and recover the expression data.
Transversal Skills.
Acquired skills will be essential elements for understanding and addressing problems in biology, pathology and molecular diagnosis.
1. Introduzione alla Biologia Computazionale
Il progetto Genoma umano
Gestione di grandi quantità di dati
Struttura di un database, record, campi, relazioni, query
Annotazione delle informazioni biologiche e interscambio
2. Banche dati genomiche
Banche dati di sequenze, mutazioni e polimorfismi
Banche dati di regolazione genica, fattori di trascrizione, microRNA
3. Banche dati proteomiche
Banche dati di sequenze, interazioni proteiche
4. Programmi di predizione dell'effetto delle mutazioni che cadono sui geni umani
Effetto delle variazioni nucleotidiche a carico del processo di splicing e dell’esporto dell’RNA
Effetto delle variazioni amminoacidiche a carico della struttura e della funzionalità proteica
1. Introduction to Computational Biology
The Human Genome Project
Managing large amounts of data
Structure of a database, records, fields, reports, queries
Annotation of biological information and interchange
2. Genomic databases
Database of sequences, mutations and polymorphisms
Gene regulation databases, transcription factors, microRNAs
3. Proteomic databases
Sequence and protein interactions databases
4. Predictions of the effect of mutations on human genes
Effect of nucleotide variations on the splicing process and the export of RNA
Effect of amino acid variations on protein structure and function
E’ prevista una prova pratica da svolgere al computer e il cui superamento è necessario per accedere all’esame orale.
Criteri di valutazione dell'apprendimento.
Nelle prove pratiche e orali lo studente dovrà dimostrare di conoscere le banche dati biologiche e saperle utilizzare per recuperare informazioni di sequenza, regolazione genica, espressione genica e mutazioni.
Criteri di misurazione dell'apprendimento.
Il voto finale è attribuito in trentesimi e l’esame si intende superato quando il voto è maggiore o uguale a 18. E’ prevista l’assegnazione del massimo dei voti con lode.
Criteri di attribuzione del voto finale.
Il voto finale viene attribuito attraverso la media della prova pratica e di quella orale. La lode viene attribuita quando lo studente dimostra piena padronanza della materia.
Learning Evaluation Methods.
A practical test will be performed on the computer and overcoming it is necessary to gain access to the oral exam.
Learning Evaluation Criteria.
In practical and oral tests, the student must demonstrate knowledge of biological databases and know how to use it to retrieve sequence information, gene regulation, gene expression, and mutations.
Learning Measurement Criteria.
The final vote is given in thirtieths and the examination is passed when the vote is greater than or equal to 18. It is foreseen that the maximum number of votes be awarded.
Final Mark Allocation Criteria.
The final vote is the average of the practical and oral tests. The honors is given when the student demonstrates full mastery of the subject.
Nessuno
None
Le informazioni contenute nella presente scheda assumono carattere definitivo solo a partire dall'A.A. di effettiva erogazione dell'insegnamento. Academic year 2018-2019
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P.zza Roma 22, 60121 Ancona
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